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牙鲆微卫星标记遗传连锁图谱的构建

文献类型: 中文期刊

作者: 宋文涛 1 ; 张潇峮 1 ; 廖小林 1 ; 邵长伟 1 ; 王磊 1 ; 庞仁谊 1 ; 牛余泽 1 ; 赵永伟 1 ; 李文龙 1 ; 梁卓 1 ; 田永胜 1 ; 陈松林 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词: 牙鲆;遗传连锁图谱;微卫星;分子标记辅助育种

期刊名称: 农业生物技术学报

ISSN: 1674-7968

年卷期: 2011 年 19 卷 06 期

页码: 7-13

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了实现分子标记或基因辅助育种在牙鲆养殖中成功运用,并快速提高牙鲆产量,使用微卫星标记首次构建了国内第一张牙鲆遗传连锁图谱。采用基因组测序的方法,筛选出大量微卫星序列,从中随机挑选1 000条序列设计合成引物,利用2009年建立的第10号家系为作图群体,使用JoinMap4.0软件,构建了牙鲆(Paralichthys olivaceus)SSR标记遗传连锁图谱。雌雄图谱分别由24个连锁群组成,其中雌性图谱标记212个,总长度1 320.4 cM,覆盖率为77.7%;雄性图谱标记198个,总长度1 361 cM,覆盖率为76.1%。每个连锁群长度变动在9.3~116.1 cM之间,连锁群上的标记数在3~21个之间。各连锁群上的SSR标记并不是均匀分布的,其中1、3和8号连锁群存在标记密集区。该图谱能够进行初步的QTL定位分析和基因定位相关研究,为开展牙鲆基因和QTL的精细定位及分子标记辅助育种(MAS)等提供更有效的依据。

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