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榛属ycf1基因生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 卫永乐 1 ; 温志芳 1 ; 刘芳 1 ; 张杰伟 1 ; 黄武刚 1 ; 兰彦平 1 ; 程丽莉 1 ; 曹庆昌 1 ; 胡广隆 1 ;

作者机构: 1.运城农业职业技术学院;北京市农林科学院

关键词: ycf1基因;榛属;基因家族;进化分析

期刊名称: 山西农业科学

ISSN: 1002-2481

年卷期: 2018 年 08 期

页码: 1244-1247+1333

摘要: 为研究ycf1基因家族成员在榛属(Corylus)中的生理功能,利用榛属叶绿体基因组数据库,经过生物信息学分析,获得榛属ycf1基因家族成员的基因结构、定位和编码蛋白,经过多重序列比对进行进化和分类分析。结果表明,榛属叶绿体基因组中的ycf1基因家族成员不含有内含子;TMHMM跨膜区结构分析显示,榛属YCF1蛋白均不含有跨膜区;MEME保守结构域分析显示,榛属YCF1蛋白均含有3个保守结构域。研究结果对解析榛属YCF1蛋白的生物学功能提供重要的线索。

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