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GmHs1~(pro-1)多样性分析及蛋白互作预测

文献类型: 中文期刊

作者: 杨若巍 1 ; 赵思阳 2 ; 李帆 2 ; 于佰双 2 ; 陈井生 2 ; 王惠 2 ; 段玉玺 3 ;

作者机构: 1.沈阳农业大学生物科学技术学院;沈阳农业大学植物保护学院;黑龙江省农业科学院;黑龙江省农业科学院大庆分院

2.;沈阳农业大学生物科学技术学院;沈阳农业大学植物保护学院;黑龙江省农业科学院;黑龙江省农业科学院大庆分院

3.;沈阳农业大学生物科学技术学院;沈阳农业大学植物保护学院;黑龙江省农业科学院;黑龙江省农业科学院大庆分院;

关键词: 抗性基因;GmHs1~(pro-1);互作预测

期刊名称: 大豆科学

ISSN: 1000-9841

年卷期: 2017 年 02 期

页码: 208-212

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: GmHs1~(pro-1)是Hs1~(pro-1)同源的抗线虫候选基因,通过使用不同的大豆品种克隆GmHs1~(pro-1)CDS区研究了其多样性、建立了进化树,并利用在线数据库分析预测了与其互作的蛋白。结果表明:在24种大豆品种中均克隆到长度约1 400bp的GmHs1~(pro-1)CDS区,同已有数据合并后该区段共有20个突变点,5个新突变点中的3个引起了编码氨基酸的变化。GmHs1~(pro-1)可能主要同glyma18g04770编码的蛋白互作,该蛋白受syringolide诱导。GmHs1~(pro-1)定位在胞浆内,具有1个吲哚化合物双加氧酶类似结构域,可能参与吲哚相关通路影响线虫发育。

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