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从江香猪源干扰素α2基因的克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 温贵兰 1 ; 陈绍品 1 ; 张升波 1 ; 林汉卿 1 ; 赵德刚 1 ;

作者机构： 1.贵州大学农业生物工程研究院山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室;贵州大学动物科学学院预防兽医实验室;贵州省农业科学院

关键词： 从江香猪;IFN-α2;基因克隆;序列分析

期刊名称： 动物医学进展

ISSN： 1007-5038

年卷期： 2018 年 12 期

页码： 54-60

收录情况： 北大核心

摘要： 选取我国珍稀物种贵州从江香猪作为研究对象,提取贵州从江香猪肝脏组织总RNA,反转录生成cDNA,采用特异性引物扩增从江香猪的IFN-α2(CJ-poIFN-α2)基因编码区,克隆至pUCm-T载体后送上海英骏公司测序,并用生物学软件对CJ-poIFN-α2基因进行序列分析。测序结果显示,从江香猪IFN-α2编码区长为546bp;序列比对结果表明CJ-poIFN-α2与猪源IFN-α2核苷酸序列同源性最高,为98.7%,遗传进化树结果也显示两者在同一分支上,说明两者遗传关系较近;在线服务器软件分析结果显示,CJ-poIFN-α2二级结构主要以α-螺旋、无规则卷曲为主,23-24aa位点预测为信号肽酶切位点;CJ-poIFN-α2基因编码蛋白B细胞表位主要位于46-48aa、56-58aa、70-73aa、155-159aa、175-178aa。试验结果为进一步研究干扰素的生物学活性、加快从江香猪的资源开发与利用奠定基础。

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