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越冬期体色变异红罗非鱼差异表达miRNA的鉴定

文献类型： 中文期刊

作者： 王兰梅 1 ; 朱文彬 1 ; 傅建军 1 ; 罗明坤 1 ; 董在杰 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心

关键词： 红罗非鱼;越冬;体色变黑;microRNA （miRNA）

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2023 年 004 期

页码： 16-26

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探究红罗非鱼越冬期体色变异的分子机制，实验构建了其2种体色（正常粉红体色和变黑体色）皮肤组织的小RNA文库，每组4个重复，组装后平均每组分别获得12 190 544和11 891 890条过滤后的读长（clean reads），获得miRNA成熟序列669个，其中337个是已知的miRNAs。鉴定出越冬期变黑体色相对于正常粉红体色鱼的差异表达miRNAs 26个，其中上调11个，下调15个，且12个为已知的miRNAs，可能在红罗非鱼越冬期体色变异过程中发挥重要作用。富集分析发现了大量代谢和体色调控相关的通路。研究表明，红罗非鱼越冬期的体色变异可能是色素细胞的增殖和迁移形成的，与代谢相关的调控通路在其中发挥重要作用，为解析红罗非鱼越冬期体色变异的机制奠定了基础。

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