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牛IRS1基因3’UTR的克隆、鉴定及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李文清 1 ; 李中举 1 ; 孟志鹏 1 ; 牛梦宇 1 ; 李万利 2 ;

作者机构: 1.河南农业大学生命科学学院河南省农业科学院畜牧兽医研究所

2.华南农业大学动物科学学院

关键词: 牛;胰岛素受体基质1;3’非翻译区;3’RACE;最小自由能

期刊名称: 河南农业大学学报

ISSN: 1000-2340

年卷期: 2017 年 01 期

页码: 48-52

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以奶牛乳腺组织为材料,采用3’RACE技术克隆到奶牛IRS1基因3’UTR的全长,进一步对测得的序列进行了验证,同时利用Target Scan 7.0和Pic Tar软件预测可能结合的microRNA,并对多个软件预测结合的microRNA,进行最小结合自由能分析。结果表明,成功克隆了1 327 bp的牛IRS1 3’UTR全长,与NCBI上的预测序列一致率达到99%;miR-128、miR-96、miR-27a为2个软件共同预测到的结合microRNA;3个结合位点的最小自由能分别为-89.58、-87.91、-100.88 k J·mol-1,表明牛IRS1基因表达可能受到这3个microRNA的调控。

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