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河北省马铃薯Y病毒株系分子鉴定及其RT-PCR检测

文献类型: 中文期刊

作者: 吴志明 1 ; 时星 2 ; 谢晓亮 1 ; 温春秀 1 ; 张庆良 3 ;

作者机构: 1.河北省农林科学院经济作物研究所

2.河北省高碑店农业局

3.河北科润农业技术有限公司

关键词: 马铃薯Y病毒;反转录-聚合酶链式反应;病毒检测;外壳蛋白基因(CP);序列分析;株系鉴定

期刊名称: 河北农业大学学报

ISSN: 1000-1573

年卷期: 2005 年 28 卷 03 期

页码: 54-59

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 根据马铃薯Y病毒(PotatovirusY,PVY)的外壳蛋白基因序列,设计合成了一对寡核苷酸引物,从感染PVY的马铃薯田间病叶组织中提取出病毒的RNA,进行cDNA合成及PCR扩增,得到一条长度约800bp的特异PCR扩增产物,与理论设计的基因片段大小一致,本试验建立了快速、灵敏、简便的PVY检测的方法。将RT-PCR扩增产物克隆到质粒pGEM-T上,并进行了序列分析。结果表明,克隆的cDNA片段由801个核苷酸组成,编码267个氨基酸组成的理论分子量为29kD蛋白,与PVY外壳蛋白的大小一致,与基因库登记的代表性株系相比,它们之间的核苷酸序列同源性为89 6%~98 8%,氨基酸序列的同源性为93 3%~98 5%,说明PVYCP基因具有高度的保守性(记为PVY-HBEI),与国内报道的PVY-CHU、PVY-ZHJ和PVY-ZHOU株系的氨基酸序列同源性分别为96 6%、98 5%和97 8%,与PVYN和PVYO株系的氨基酸序列同源性分别为93 6%和97 8%,从分子水平上确定PVY-HBEI归属于普通株系(PVYO株系)。

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