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樱桃番茄Cf9基因调控元件预测及同源基因系统发育分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘子记 1 ; 刘维侠 1 ; 牛玉 1 ; 杨衍 1 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

关键词: 启动子;表达调控;同源基因;同源指数;基因进化

期刊名称: 种子

ISSN: 1001-4705

年卷期: 2020 年 01 期

页码: 13-17+25

收录情况: 北大核心

摘要: 为探明Cf9基因的表达调控元件和同源基因进化关系,从樱桃番茄品种京番红星中克隆了Cf9上游序列,利用PlantCARE启动子预测工具对转录起始位点上游1 500 bp序列进行顺式调控元件分析。结果表明,Cf9启动子不仅含有TATA-box和CAAT-box等核心元件,而且含有光响应元件、茉莉酸甲酯响应元件、水杨酸响应元件等。Cf9基因可能受光、水杨酸和茉莉酸甲酯等诱导表达。Cf9同源基因系统进化分析结果表明,当同源指数为0.65时,番茄、马铃薯、辣椒、烟草中含有Cf9同源基因,同源基因既包括旁系同源基因,也包括直系同源基因,分析结果也进一步说明番茄与马铃薯的亲缘关系最近,其次为辣椒、烟草。

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