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椰子基因组DNA的提取及SSR反应体系的优化

文献类型: 中文期刊

作者: 吴翼 1 ; 武耀廷 2 ; 马子龙 1 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院椰子研究所

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

关键词: 椰子;DNA提取;SSR;优化

期刊名称: 中国农学通报

ISSN: 1000-6850

年卷期: 2008 年 24 卷 03 期

页码: 417-422

收录情况: 北大核心

摘要: 以马哇、文椰78F1和海南高种为试材,利用改良的CTAB法提取的基因组DNA纯度高,完整性好。将PCR体系的主要成分设定5个梯度,根据每个成分的变化引起的PCR-SSR的效果差异,探讨了椰子SSR技术中PCR体系的主要成分对扩增结果的影响,并对引物co007的适宜退火温度进行优化。最终确定了引物co007的最适退火温度为46.4~54℃,20μlPCR反应体系的最佳条件为:Mg2+浓度为2.0~4.0mmol/L,dNTPs的浓度为0.1~0.25mmol/L,Taq聚合酶用量为1.0~2.0U,引物浓度为0.5~2.0μmol/L。利用此反应体系对部分椰子品种进行PCR扩增并电泳检测,扩增结果清晰且有较高的多态性,表明该体系适合椰子的亲缘关系分析。

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