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基于转录组测序的油棕脂肪酸合成基因的筛选及分析

文献类型： 中文期刊

作者： 周丽霞 1 ; 吴翼 1 ; 张安妮 1 ; 杨耀东 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院椰子研究所

关键词： 油棕;转录组测序;功能注释;油脂合成

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年 21 卷 005 期

页码： 1468-1474

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 油棕是世界上单位面积产油量最高的油料作物,其主要经济产物—棕榈油是目前世界上生产量、消费量和国际贸易量最大的植物油品种,但其合成的分子调控机理尚不清楚.为挖掘油脂合成关键基因,本试验分别以授粉后81、95、110、127、142和152 d的油棕中果皮和果仁为研究对象,对其进行转录组测序,应用生物信息学对所获得的转录组数据进行整合与基因分析.结果表明,共检测出47 951个编码序列,6.56Gb的数据量,平均长度为1 164 bp,N50及N70均大于1 000 bp,经组装后共获得29 008个Unigene,该结果说明测序所得的数据拼接组装质量较高.在NR、COG、KEGG、Swissprot以及Interpro 5个数据库中均被注释上的基因数为13 286个,占总Unigene的27.7%.通过GO注释,将32 378个基因分为三大功能类,分别是生物过程、细胞组分和分子功能,共31个功能组.共有10 220条Unigene被注释到5大类、19个亚类KEGG途径中,根据KEGG通路map02310,将注释基因进行分类,并获得油棕脂肪酸合成相关基因126个.本研究为油棕遗传育种及品质性状的改良提供数据支撑.

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