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椰子CESA基因家族鉴定及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孙熹微 1 ; 杨耀东 2 ; 弓淑芳 2 ; 王永 1 ; 肖勇 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院椰子研究所

2.海南省热带油料作物生物学重点实验室

关键词： 椰子（Cocos nucifera L.）;CESA基因家族;生物信息学

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2024 年 013 期

页码： 4212-4221

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 中国加工椰糠与椰壳纤维所需的椰衣、椰壳主要从国外进口，国内原材料供给不足，市场潜力巨大，因此培育椰子高品质深加工新品种具有重要意义。本研究利用已发表的椰子基因组数据，共鉴定出10个椰子CESA基因家族成员并对其进行了基因结构分析、蛋白理化性质分析、亚细胞定位预测、蛋白质保守结构域预测、超二级结构预测分析、三级结构同源建模、蛋白跨膜螺旋预测、系统进化树构建及表达谱分析。蛋白理化性质与亚细胞定位分析显示，椰子CESA成员蛋白多为酸性蛋白，且主要定位于细胞质膜上。进化分析显示，椰子CESA基因家族成员可分为5组，组内基因同源性较高，组间差异较小，所有家族成员均含有N端锌指结构域和纤维素合酶结构域，基因结构相似。聚类及表达谱分析显示，CoCESA3、CoCESA4、CoCESA6、CoCESA8与已报道的拟南芥、水稻初生细胞壁合成相关CESA基因聚类在一起，并在成熟叶片、幼叶、胚、胚乳和愈伤组织中都有较高的表达量，其可能参与了初生细胞壁合成且在整个植物生长发育过程中发挥作用。本研究鉴定了10个椰子CESA基因家族成员并对其进行了生物信息学分析，为椰子CESA基因家族功能的进一步研究提供基础，并为高质量深加工椰子新品种的分子育种提供候选基因。

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