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基于重测序的槟榔InDel标记开发及应用

文献类型： 中文期刊

作者： 齐兰 1 ; 杨耀东 1 ; 黄丽云 1 ; 杨玉娟 2 ; 尹永梅 2 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院椰子研究所

2.云南农业大学

关键词： 槟榔;基因组重测序;InDel标记;遗传多样性

期刊名称： 分子植物育种

ISSN：

年卷期： 2024 年 005 期

页码： 1501-1507

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 槟榔是海南重要的热带特色经济作物，栽培品种‘热研一号’全基因组已经公布，为InDel标记的开发提供研究基础。本研究利用果实为长椭圆形的槟榔材料的重测序数据与参考基因组序列比对，在1号染色体上选取42个In Del位点设计引物，筛选出16对多态性好的引物对24份槟榔种质资源进行遗传多样评价，每个标记的信息多样性（PIC）值变幅为0.115 0～0.414 5，平均值0.325 8，进行聚类分析，在遗传相似系数0.64处将供试材料分为3组，一份来自云南的卵形果单独聚类为第Ⅲ组，来自台湾的2份资源与斯里兰卡的3份材料聚类为一个分支，大部分材料划分到第Ⅱ组，均为来自海南的栽培品种，表明国外收集引进的资源拓宽了海南栽培槟榔的遗传基础。本研究开发的InDel标记能有效地揭示不同材料间的遗传距离，反映种质资源之间的亲缘关系，将来可有效应用于遗传连锁图谱构建、关联分析等方面的研究。

  • 相关文献

[1]基于木薯全基因组重测序的InDel标记开发及应用. 陆佳毓,王明,肖鑫辉,李开绵,张洁,薛茂富,符乃方,万仲卿,王颜. 2024

[2]海南槟榔产业前景分析. 周焕起.

[3]槟榔资源鲜果的质构评价研究. ZHOU Huanqi,周焕起,HUANG Liyun,黄丽云,LIU Liyun. 2015

[4]海南屯昌县生态型高新农业调查报告. 谭勇,温春生,陈秋波. 2009

[5]低温对槟榔幼苗生理生化特性的影响. 吴敏,曹红星,冯美利,陈思婷,王贵美,李杰. 2010

[6]槟榔、橡胶化感作用的初步研究. 颜桂军,朱朝华,陈秋波,邱庆军,刘美珍. 2006

[7]万宁市槟榔主要害虫的发生与防治. 黄山春,许喆,林松,覃伟权,刘丽,朱辉,阎伟. 2014

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[10]不同密度槟榔问作对香草兰叶绿素荧光特性的影响. 王辉,庄辉发,宋应辉,赵青云,朱自慧,王华. 2012

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[18]槟榔果实脂溶性化学成分的GC-MS分析. 郭志凯,梅文莉,曾艳波,王辉,戴好富. 2012

[19]基于SWOT分析的海南省槟榔产业发展思考. 王华,冯焕德,王登峰. 2019

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