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宁夏马铃薯镰刀菌根腐病病原菌的ISSR-PCR标记体系建立及其遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王喜刚 1 ; 杨波 2 ; 郭成瑾 1 ; 张丽荣 1 ; 沈瑞清 1 ;

作者机构: 1.宁夏农林科学院植物保护研究所

2.宁夏大学农学院

关键词: 宁夏;马铃薯;镰刀菌根腐病;ISSR-PCR;遗传多样性

期刊名称: 植物保护学报

ISSN:

年卷期: 2020 年 005 期

页码: 1019-1029

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为明确宁夏马铃薯镰刀菌根腐病病原菌种内的遗传差异与亲缘关系,利用ISSR-PCR技术对影响PCR扩增效果的因素和ISSR引物进行优化和筛选,建立适合马铃薯镰刀菌根腐病病原菌的ISSR-PCR反应体系,并通过ISSR分子标记技术对30株地理来源不同的镰刀菌进行遗传多样性分析.结果显示:马铃薯镰刀菌根腐病病原菌的ISSR-PCR扩增最适引物为807,20μL反应体系中2*Easy Taq PCR Super Mix为8μL、引物浓度为0.6μmol/L、DNA模板浓度为56 ng/μL,循环次数为36次,退火温度为54℃.在选用的18条ISSR引物中有13条对30株镰刀菌扩增出84条条带,大小多分布在250~2 000 bp之间,其中多态性条带为82条,多态性比例平均为98.3%.30株镰刀菌的遗传相似系数在0.349~0.976之间,在0.478水平上可划分为2个类群,其中类群I包括尖孢镰刀菌Fusarium oxysporum、木贼镰刀菌F. equiseti、茄病镰刀菌F. solani和锐顶镰刀菌F. acuminatum;类群II全部为接骨木镰刀菌F. sambucinum;在0.976水平上30株镰刀菌可被全部区分开.ISSR类群划分与菌种分类之间存在一定相关性,同一类群不同菌株之间的遗传相似性与菌株地理来源存在一定的相关性;分离自同一地区的同一菌种,其菌株间也存在一定的遗传差异性.

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