文献类型： 中文期刊

作者： 勿都巴拉 ¹ ; 刘斌 ² ; 郭俊 ² ; 阿云嘎 ² ; 杨军 ² ; 乌日格希拉图 ² ; 李金泉 ² ; 李玉荣 ³ ;

作者机构： 1.内蒙古农业大学动物科学学院;内蒙古农牧业科学院畜牧研究所;中国科学院昆明动物研究所;鄂托克前旗兽医局

2.;内蒙古农业大学动物科学学院;内蒙古农牧业科学院畜牧研究所;中国科学院昆明动物研究所;鄂托克前旗兽医局

3.;内蒙古农业大学动物科学学院;内蒙古农牧业科学院畜牧研究所;中国科学院昆明动物研究所;鄂托克前旗兽医局;

关键词： 绒山羊;光控增绒;褪黑激素;差异表达基因;网络分析

期刊名称： 中国农业大学学报

ISSN： 1007-4333

年卷期： 2017 年 09 期

页码： 45-54

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究光控增绒和埋置褪黑激素促进绒山羊在非产绒季节(5—8月份)长绒的皮肤毛囊差异表达基因之间的互作关系,并筛选出皮肤毛囊发育相关的重要功能基因,以Agilent绵羊的全基因组表达谱芯片杂交获得的光控增绒羊皮肤差异表达的99个基因及埋置褪黑激素绒山羊皮肤差异表达的83个基因作为研究对象,结合NCBI数据库,利用RStudio程序包和Cytoscape 3.3.0构建差异基因网络并分析。光控增绒试验组差异基因构建了1个主网络和4个小网络;对照组差异基因构建了1个主网络和5个小网络。与表达量结合分析基因网络发现,K25、KAP16-2基因上调促进ISG17、RSRP1、GIMAP1和CYTIP基因的下调,间接促进TNFAIP6基因的下调;CYP17A1、V15和K2-12(K85)基因的上调促进ddit3基因的下调;KAP16-3基因促进CYP17A1基因的同时抑制CYP1A1基因。埋置褪黑激素试验组差异基因构建了2个主网络和7个小网络,对照组差异基因构建了3个主网络和1个小网络。与表达量结合分析基因网络发现,CTNNB1基因的上调促进COL3A1基因的下调;FLT-1基因的上调促进CGA基因的上调和COL1A2基因的下调;PAX6基因的上调促进DOK4基因的上调和LOC101110099基因的下调;P450基因的上调促进BLG基因的下调。光控增绒羊皮肤中筛选出来的基因中角蛋白、角蛋白关联蛋白、CYP17A1、SP-D等23个显著上调基因和CYP1A1、COL6A5、LOC100101238、ddit3等13个显著下调基因对光控增绒羊皮肤毛囊提前进入兴盛期有重要作用;埋置褪黑激素的绒山羊皮肤中筛选出来的基因中CTNNB1、PAX6、DOK4、LOC105602529等13个显著上调基因和酪蛋白家族、胶原蛋白类、LOC101110099等12个显著下调基因之间的信号传导增强,从而促进绒山羊绒毛进入兴盛期。