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山羊磷脂氢谷胱甘肽过氧化物酶生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 施力光 1 ; 荀文娟 1 ; 周汉林 1 ; 侯冠彧 1 ; 岳文斌 2 ; 张春香 2 ; 杨茹洁 3 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

2.山西农业大学

3.山西农业大学太原畜牧兽医学院

关键词： 山羊;PHGPx基因;RACE;克隆;序列分析

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2012 年 0 卷 12 期

页码： 106-113

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在克隆山羊磷脂氢谷胱甘肽过氧化物酶(PHGPx)基因cDNA全序列并进行序列分析。提取山羊睾丸中总RNA,利用RT-PCR和RACE技术,扩增山羊PHGPx基因cDNA序列并对其生物信息学进行分析。结果表明,山羊PHGPx基因cDNA序列全长844 bp,共编码199个氨基酸;山羊与牛、猪、人和小鼠的氨基酸序列同源性均大于90%;山羊PHGPx蛋白二级结构功能区域属谷胱甘肽过氧化物酶家族,预测23-24和28-29氨基酸位点有潜在的信号肽位点;UPGMA算法构建该物种间分子系统进化树,山羊与牛先聚为一类,再分别与猪、鼠、人、鸡聚类,最后与蜜蜂聚类,与物种动物学分类基本吻合。首次克隆了山羊PHGPx基因,具有GSH-Px家族典型特征,研究结果将为PHGPx基因表达分子调控研究提供一定的理论依据。

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