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玉米发芽期响应盐胁迫的转录组分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王星哲 1 ; 武悦 2 ; 王艺煊 2 ; 王瑞莲 2 ; 周文新 1 ; 李瑞莲 1 ; 陈阳 2 ;

作者机构: 1.湖南农业大学农学院

2.巴彦淖尔市农牧业科学研究院农业生物技术研究中心

关键词: 玉米;盐胁迫;发芽期;转录组

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2023 年 002 期

页码: 370-378

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 玉米种子发芽期对盐分较为敏感,为了进一步明确玉米发芽期对盐胁迫的应答机制,本研究利用高通量转录组测序技术,对玉米耐盐自交系昌7-2在150 mmol/L NaCl胁迫下的胚芽进行转录组测序和数据分析。结果表明:共有40 290个Unigenes获得功能注释,其中差异表达基因615个。在差异表达基因的GO富集分析中,对富集程度明显的前20个类别做出功能分析。有21个DEGs富集到苯丙烷类的生物合成途径,是KEGG富集分析最显著的通路。对差异表达基因进行COG分类,共得到25个不同的COG功能注释。通过对目标基因的挖掘共得到13个较重要的转录因子,涉及到MYB、WRKY、AP2、bZIP、bHLH和NAC等6个家族。本研究为挖掘玉米耐盐相关基因、解析玉米响应盐胁迫的分子调控机制提供科学依据。

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