文献类型: 中文期刊
作者: 王星哲 1 ; 武悦 2 ; 王艺煊 2 ; 王瑞莲 2 ; 周文新 1 ; 李瑞莲 1 ; 陈阳 2 ;
作者机构: 1.湖南农业大学农学院
2.巴彦淖尔市农牧业科学研究院农业生物技术研究中心
关键词: 玉米;盐胁迫;发芽期;转录组
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2023 年 002 期
页码: 370-378
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 玉米种子发芽期对盐分较为敏感,为了进一步明确玉米发芽期对盐胁迫的应答机制,本研究利用高通量转录组测序技术,对玉米耐盐自交系昌7-2在150 mmol/L NaCl胁迫下的胚芽进行转录组测序和数据分析。结果表明:共有40 290个Unigenes获得功能注释,其中差异表达基因615个。在差异表达基因的GO富集分析中,对富集程度明显的前20个类别做出功能分析。有21个DEGs富集到苯丙烷类的生物合成途径,是KEGG富集分析最显著的通路。对差异表达基因进行COG分类,共得到25个不同的COG功能注释。通过对目标基因的挖掘共得到13个较重要的转录因子,涉及到MYB、WRKY、AP2、bZIP、bHLH和NAC等6个家族。本研究为挖掘玉米耐盐相关基因、解析玉米响应盐胁迫的分子调控机制提供科学依据。
- 相关文献
[1]基于RNA-Seq技术挖掘绵羊背最长肌肉质性状相关基因. 王位,付绍印,何小龙,王艳欣,王月星,王标,刘斌,刘永斌,张文广. 2018
[2]马铃薯萌芽出苗期根系对水分胁迫的响应机理分析. 王晓娇,蒙美莲,曹春梅,逯春杏,许飞. 2019
[3]转录组研究新技术:RNA-Seq及其应用. 祁云霞,刘永斌,荣威恒. 2011
[4]基于RNA-Seq分析褪黑激素对绒山羊皮肤基因表达的影响. 丽春,付绍印,王建蒙,王位. 2018
[5]葫芦巴转录组测序及生物信息学分析. 王星哲,陈阳,武悦,单飞彪,杜瑞霞,闫文芝,刘春晖. 2024
[6]巨菌草分子研究及生态修复应用的进展. 史志丹,郭呈宇,房永雨,伊风艳,刘思博,皇甫海燕,孙红霞,丁海君. 2023
[7]粳糯谷胚乳灌浆期差异表达基因富集分析. 李强,李涛,郭世华,白玉婷,李星聪. 2021
[8]植物提取物复合制剂缓解奶牛乳腺上皮细胞炎症反应的分子机制. 张腾龙,郭晨阳,宋洁,敖长金,王丽芳. 2023
[9]甜菜雄性不育系及保持系花蕾差异基因转录组测序分析. 张必周,白晨,吴新荣,张自强,王良,韩平安,张惠忠,李晓东. 2024
[10]不同耐旱性紫花苜蓿干旱胁迫下生理响应和转录调控的差异研究. 陈力,王靖,邱晓,孙海莲,张文浩,王天佐. 2023
[11]向日葵对盐胁迫的反应及其抗盐机理的研究进展. 聂惠,于海峰,刘浩明. 2008
[12]向日葵盐胁迫相关基因的cDNA-AFLP差异表达. 孙瑞芬,张艳芳,郭树春,于海峰,李素萍,乔慧蕾,聂惠,安玉麟. 2015
[13]基于RNA-Seq技术的盐胁迫向日葵转录组信息分析. 孙瑞芬,张艳芳,郭树春,于海峰,李素萍,聂惠,乔慧蕾,安玉麟. 2015
[14]盐胁迫对小黑麦淀粉合成相关基因表达及淀粉含量的影响. 何江峰,刘红葵,陆振翔,赵萌莉. 2013
[15]盐胁迫对向日葵幼苗生长和生理特性的影响. 王伟,于海峰,张永虎,李素萍,聂慧,侯建华. 2013
[16]向日葵ACC氧化酶基因(HaACO1)的克隆及表达分析. 孙瑞芬,张艳芳,郭树春,于海峰,李素萍,乔慧蕾,聂惠,安玉麟. 2015
[17]油葵杂交种耐盐性鉴定及幼苗对盐胁迫的生理响应. 张艳芳,孙瑞芬,郭树春,侯建华. 2016
[18]燕麦萌发耐盐性及指标筛选. 陶金,侯龙鱼,杨杰,宋世环,白文明,潘庆民,殷淑艳,郝建玺,张文浩. 2018
[19]盐胁迫对燕麦种子萌发、幼苗生长及叶片质膜透性的影响. 武俊英,刘景辉,李倩,付增娟. 2009
[20]盐胁迫对辣椒幼苗根、茎、叶显微结构的影响. 姜伟,崔世茂,李慧霞,张轶婷,白红梅. 2017
作者其他论文 更多>>
-
葫芦巴转录组测序及生物信息学分析
作者:王星哲;陈阳;武悦;单飞彪;杜瑞霞;闫文芝;刘春晖
关键词:葫芦巴;转录组;Unigene;分子标记
-
氮肥施用量、种植密度、刈割期及其互作对蒙啤麦5号饲草产量及营养品质的影响
作者:徐广祥;刘琳;吕二锁;王艺煊;刘志萍;郭呈宇;贾英;敖特恒格日乐
关键词:氮肥;刈割期;蒙啤麦5号;品质
-
基于高通量测序的瞿麦叶片转录组分析
作者:武悦;单飞彪;闫文芝;杨蕾;李彦标;陈阳
关键词:瞿麦(Dianthus superbus);转录组;基因注释;代谢通路;简单重复序列
-
扁茎黄芪转录组测序及生物信息学分析
作者:武悦;陈阳;王星哲;单飞彪;张勇;孙鸿举
关键词:扁茎黄芪;转录组;生物信息学;Unigene;分子标记
-
油莎豆转录组测序及生物信息学分析
作者:陈阳;闫文芝;张春;武悦;佟臻昊;顾敏;单飞彪
关键词:油莎豆(Cyperus esculentus);RNA-Seq;转录组;SNP
-
玉米种质资源抗旱性评价方法鉴评与抗旱资源筛选
作者:王艺煊;李成;康洪彪;陈阳;王兆娟;杨毅成;苏二虎;王瑞莲;王志刚
关键词:春玉米;种质资源;抗旱性评价;加权隶属函数
-
玉米新品种青贮808的选育与栽培技术研究
作者:李成;王瑞莲;王艺煊;杨毅成;陈阳;康洪彪;王兆娟;许有光;张代勇
关键词:玉米;育种;栽培;青贮808