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玉米穗粗一般配合力多位点全基因组关联分析和基因组预测

文献类型： 中文期刊

作者： 马娟 1 ; 黄璐 1 ; 宇婷 1 ; 郭国俊 1 ; 朱卫红 1 ; 刘京宝 1 ;

作者机构： 1.河南省农业科学院粮食作物研究所

关键词： 玉米;穗粗;一般配合力;多位点全基因组关联分析;基因组选择;固定效应模型

期刊名称： 作物杂志

ISSN：

年卷期： 2024 年 001 期

页码： 31-39

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 穗粗是一个重要的穗部性状，一般配合力（GCA）是杂交育种中衡量亲本组配能力的一个重要指标。以NCII遗传交配设计组配的537个F1杂交组合为材料，利用7种多位点全基因组关联分析方法（MGWAS）对河南新乡、周口和综合环境穗粗GCA开展定位分析，并研究MGWAS方法挖掘的显著关联位点作为固定效应对穗粗GCA预测准确性的影响，为穗粗GCA关键位点的基因组选择（GS）育种利用提供指导。结果表明，共检测到18个穗粗GCA显著关联SNP（P＜8.52E-07），其中6个位点利用2～5种MGWAS方法同时检测到，3个位点在2个环境中均检测到。5种GS随机效应模型对3个环境穗粗GCA预测准确性均较低，为0.32～0.44。3个环境中，显著位点作为固定效应加入预测模型中均能有效地提高穗粗GCA基因组预测能力，可将预测精度提高到0.38～0.64。

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