文献类型： 中文期刊
作者： 姜娜 1 ; 邢薇 1 ; 李铁梁 1 ; 罗琳 1 ; 闫兵兵 2 ;
作者机构： 1.北京市水产科学研究所
2.北京市水产科学研究所渔业生物技术北京市重点实验室上海海洋大学天津科技大学
关键词： 鳗弧菌;质粒;测序;基因预测;复制区
期刊名称： 黑龙江畜牧兽医
ISSN： 1004-7034
年卷期： 2016 年 23 期
页码： 18-21+296
收录情况： 北大核心
摘要： 为了从条件致病菌鳗弧菌中提取到天然质粒,获得该质粒的全序列,并得到在弧菌中起复制作用的区域,试验采用向上引物和向下引物共9条,双向测通该质粒,经拼接得到质粒p JV的全序列,利用Glimmer3基因预测软件对该质粒可能包含基因模型进行预测和基因注释,通过在线工具OriFinder预测分析该质粒的复制区域,并将该区域克隆到T载体中,验证重组质粒在弧菌科菌种中的复制效果。结果表明:该质粒p JV全长5 982 bp(Gen Bank登录号为JQ782192),有4个含有核糖体结合位点的基因(UQY-2、UQY-3、UQY-4、UQY-6);质粒p JV的复制元件是一段长313 bp的序列(含Dna A boxes)。说明经过试验验证,该片段使T载体具有在维氏气单胞菌中复制的能力,即证明该片段为鳗弧菌质粒p JV的复制区,可用于新弧菌科载体的构建和疫苗研制等。
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