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脑缺血再灌注损伤后小分子RNA的分析

文献类型： 中文期刊

作者： 高蕊 1 ; 甘尚权 2 ;

作者机构： 1.石河子大学医学院生化教研室

2.新疆农垦科学院

关键词： 高通量测序;脑缺血再灌注;小分子RNA

期刊名称： 山东大学学报(医学版)

ISSN： 1671-7554

年卷期： 2011 年 10 期

页码： 95-100

收录情况： 北大核心

摘要： 目的检测假手术和脑缺血再灌注大鼠脑组织小分子RNA的差异表达。方法选取假手术组(F)和脑缺血再灌注组(B)大鼠海马脑组织,提取小分子RNA,应用Solexa高通量测序技术进行深度测序,通过信息分析获得miRNA的表达情况。结果 F组和B组分别获得6 833 331和6 407 399个序列,平均长度均为22 nt。将原始数据与mjRbase、Genbank和Rfam(9.1)数据库进行比对和分类注释。在F组和B组,miRNA总数分别占小分子RNA总数的76.77%和75.22%,两组间共有32种差异表达的mjRNA,预测出新的候选miRNA 130条。结论 Solexa测序是一种快速、全面地研究和发现小分子RNA的重要手段,筛选出的差异表达及候选miRNA可能参与脑缺血再灌注的发展。

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