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青稞耐低氮相关类甜蛋白基因HvTOND1克隆和亚细胞定位研究

文献类型: 中文期刊

作者: 安立昆 1 ; 姚有华 1 ; 姚晓华 1 ; 吴昆仑 1 ;

作者机构: 1.青海大学农林科学院

关键词: 青稞;类甜蛋白;HvTOND1基因;生物信息学分析

期刊名称: 西北农业学报

ISSN: 1004-1389

年卷期: 2021 年 30 卷 008 期

页码: 1157-1166

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了探索青稞耐低氮相关类甜蛋白基因HvTOND1的基因和蛋白结构特点,为青稞耐低氮分子机制研究提供基础.以青稞'昆仑14'叶片为材料,根据植物基因组数据库Gramene(http://www.gramene.org/)中的大麦HvTOND1(HORVU5Hr1G005300)基因和启动子区域序列设计引物,通过PCR获得青稞'昆仑14'HvTOND1基因和启动子区域序列.采用生物信息学软件对HvTOND1基因启动子区域元件以及蛋白理化性质、跨膜结构、磷酸化位点、信号肽、二级结构、三级结构进行分析.结果 表明HvTOND1没有内含子,HvTOND1蛋白由171个氨基酸组成,具有4个磷酸化位点,具有信号肽,不具有跨膜结构.将Hv-TOND1与其他植物的氨基酸序列进行对比并构建进化树发现青稞HvTOND1与节节麦AtsTOND1亲缘关系最近.亚细胞定位结果显示HvTOND1定位在内质网中.

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