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向日葵HaKASI基因的生物信息学和表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 周菲 1 ;

作者机构： 1.黑龙江省农业科学院博士后科研工作站;黑龙江省农业科学院经济作物研究所

关键词： 向日葵;油酸;HaKASI;生物信息学;表达分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2024 年 22 卷 008 期

页码： 2495-2500

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： KASI编码β-酮脂酰-ACP合酶Ⅰ,主要催化C4-ACP生成C16-ACP.为了解向日葵HaKASI基因的表达特性及功能,本研究对其编码蛋白进行生物信息学和基因表达模式分析,预测HaKASI为酸性且为亲水性蛋白;结果显示二级结构主要是无规则卷曲,预测亚细胞定位于叶绿体.系统进化分析发现,HaKASI与拟南芥及其他物种的KASI聚在一个大分支上,与莴苣(Lactuca sativa L.)KASI进化关系最近,序列相似性高达92%.HaKASI表达分析结果表明,HaKASI在向日葵种子中表达最高,其次为管状花和茎,在叶、舌状花和根中不表达,HaKASI在高、低油酸种子发育不同时期表达趋势大体一致,表达量均从7~12DAF升高,之后降低,但在37 DAF,HaKASI在低油酸种子中表达量极高,明显高于高油酸种子,这暗示HaKASI在油酸含量不同的向日葵种子发育后期可能存在不同的表达调控机制.本研究为HaKASI基因功能的研究提供科学依据.

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