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羊妊娠相关糖蛋白5的制备及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 卢春霞 1 ; 刘长彬 1 ; 倪建宏 1 ; 傅祥伟 1 ; 周平 1 ; 卢守亮 1 ; 万鹏程 1 ;

作者机构: 1.长江师范学院现代农业与生物工程学院;新疆农垦科学院畜牧兽医研究所;中国农业大学动物科学技术学院

关键词: 妊娠相关糖蛋白;密码子优化;重组蛋白;真核表达

期刊名称: 畜牧与兽医

ISSN: 0529-5130

年卷期: 2023 年 55 卷 001 期

页码: 20-29

收录情况: 北大核心

摘要: 旨在异源表达羊妊娠相关糖蛋白5(ovPAG5),并对其蛋白结构及功能进行预测分析,为ovPAG5抗体制备和羊早孕诊断技术的研发提供技术支撑.利用生物信息学方法对ovPAG5基因的编码序列进行密码子偏好性分析,根据宿主细胞HEK293的密码子偏好性对ovPAG5基因进行优化,全基因合成后构建重组表达载体pcDNA3.1(-)-ovPAG5,转染至HEK293细胞中诱导表达重组蛋白并纯化,进一步利用生物信息学软件对ovPAG5蛋白的结构及功能进行预测.结果显示,ovPAG5基因有效密码子数(NEC)和密码子适应指数(CAI)分别为51.91和0.78,表明该基因密码子选择偏性较弱.优化后ovPAG5基因密码子适用指数(CAI)由0.78提高到0.96,GC总含量由48%提高到57%,并成功合成优化的ovPAG5基因,大小与预期结果相符.重组质粒测序结果显示,其核苷酸序列与优化后基因完全一致,氨基酸未发生突变.表达的重组蛋白ovPAG5经SDS-PAGE和Western Blot鉴定分析,其相对分子质量约52 kDa.生物信息学预测分析结果显示,ovPAG5蛋白具有2个糖基化修饰位点、12个B细胞抗原表位以及31个氨基酸残基组成的信号肽.其二级结构由无规则卷曲(40.81%)、延伸链(31.74%)、α-螺旋(22.17%)和β转角(5.29%)组成.本研究为今后.vPAG5抗体的制备和羊早孕检测技术的研发奠定了基础.

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