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基于重测序的杨梅InDel标记开发与果实性状关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张淑文 1 ; 俞浙萍 1 ; 孙鹂 1 ; 武祥琪 1 ; 梁森苗 1 ; 郑锡良 1 ; 戚行江 1 ;

作者机构： 1.浙江省农业科学院园艺研究所

关键词： 杨梅;优株;InDel标记;果实性状;关联分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 20 卷 006 期

页码： 1890-1900

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 基于杨梅(Myrica rubar Sieb.et Zucc.)重测序数据,开发了覆盖基因组的InDel标记,以10份种质资源为试验材料进行了果实性状统计分析、群体结构与聚类分析、关联分析与基因预测.结果显示:10个果实外观性状中变异系数在0.64%~7.13%之间,13个果实品质性状中变异系数在2.05%~12.09%之间,总酸变异系数最大,试材表型变异范围较大;92个InDel标记在10份种质中均具有多态性,共扩增出293个位点,平均每个标记检测到等位变异位点3.18个;群体结构与聚类分析表明,试材可分为2个亚群,分别是以'荸荠种'和'东魁'为代表材料的亚群,并且3个优株均与代表材料间存在核苷酸差异;关联分析发现,24个InDel标记关联到22个性状和77个位点,其中2个标记与6个性状关联,5个标记与4个性状关联,说明在杨梅中也普遍存在不同性状的连锁遗传现象;通过对关联基因预测,共检测到5个相关功能的候选基因.本研究中开发的高质量InDel标记为杨梅种质遗传多样性分析提供鉴定基础,筛选到的候选基因为分子辅助育种提供了理论依据.

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