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草莓DHAR基因密码子偏好性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘万达 1 ; 张丙秀 2 ; 魏媛媛 2 ; 王禹 1 ; 董超 2 ; 朱延明 3 ;

作者机构: 1.黑龙江省农业科学院园艺分院

2.东北农业大学园艺学院

3.东北农业大学生命科学学院

关键词: 草莓;DHAR;密码子偏好性;聚类分析;基因表达

期刊名称: 北方园艺

ISSN: 1001-0009

年卷期: 2014 年 14 期

页码: 92-97

收录情况: 北大核心

摘要: 以草莓为试材,运用CHIPS、CUSP和CodonW程序分析了草莓DHAR基因的密码子偏好性,并与大肠杆菌和酵母的基因组密码子偏好性及7种植物的DHAR基因密码子偏好性进行了比较,同时基于DHAR基因的密码子使用偏好性进行了系统聚类分析,以期在作物遗传改良中为草莓DHAR基因选择合适的遗传转化受体及进行基因优化提供依据。结果表明:草莓DHAR基因更适合导入苹果等双子叶植物中,若要提高草莓DHAR基因在大肠杆菌或酵母中的表达水平,还需进行密码子的优化。

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