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两个油菜品系的fad2和sad基因序列差异比较

文献类型: 中文期刊

作者: 龙卫华 1 ; 浦惠明 1 ; 陈松 1 ; 高建芹 1 ; 胡茂龙 1 ; 张洁夫 1 ; 戚存扣 1 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院经济作物研究所国家油菜改良中心南京分中心

关键词: 油菜;油酸含量;fad2基因;sad基因;克隆

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2011 年 27 卷 06 期

页码: 203-209

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以来源相同而油酸含量差异显著的两个甘蓝型油菜DH品系WH141和WH149为研究材料克隆了与油酸含量相关的两个关键基因fad2(脂肪酸脱氢酶基因)和sad(硬脂酰ACP脱氢酶基因),并对克隆序列多次测序,利用DNAman软件分析两个基因序列差异。结果表明:①以fad2基因序列中的6个连续变异碱基为依据可将该基因分为2类,AF型和AY型。两者均存在于WH141和WH149品系中。AF型序列内两品系共有3处有义突变,但两品系对应氨基酸的出现频率有明显差异,说明相应fad2基因的拷贝数在两品系中有较大差异。另外,在氨基酸序列中第241位疏水氨基酸F变异为极性氨基酸Y,可能对该基因的功能有较大影响。AY型序列内,除了单碱基变异外,还存在小片段的插入缺失。单碱基变异大部分对应翻译不同种类的氨基酸。片段的插入缺失导致多个读码框出现,比较后发现WH141和WH149有3个相同的读码框,而且在WH149中发现还有2个可能的fad2基因特异表达框。②对比两品系sad基因的外显子序列后发现,WH141和WH149存在14个位点的单碱基变异,且绝大部分变异位点编码的氨基酸发生了改变。

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