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油棕种壳厚度控制基因SHELL的SNP分子标记开发

文献类型： 中文期刊

作者： 石鹏 1 ; 夏薇 2 ; 肖勇 2 ; 王永 2 ; 曹红星 2 ; 李东霞 2 ; 雷新涛 3 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院椰子研究所;海南省热带油料作物生物学重点实验室;海南大学

2.;中国热带农业科学院椰子研究所;海南省热带油料作物生物学重点实验室;海南大学

3.;中国热带农业科学院椰子研究所;海南省热带油料作物生物学重点实验室;海南大学;

关键词： 油棕;种壳厚度;SHELL基因;错配碱基;SNP标记

期刊名称： 广西植物

ISSN： 1000-3142

年卷期： 2018 年 02 期

页码： 195-201

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 油棕属棕榈科多年生木本油料作物,果实含油量高达50%,且单位面积产油量高,享有"世界油王"美誉。油棕果实由外果皮、中果皮、内果皮(种壳)、种子四个部分组成,产油部分主要是中果皮和种子,其中种壳厚度是影响果实含油量的重要因素。SHELL基因控制种壳厚度,是一类MADS-box同源基因,SHELL基因在厚壳种和无壳种中的变异主要是第一个外显子上的两个SNP位点。该研究根据两个SNP位点进行特异标记开发,根据已知的油棕SHELL基因的序列,设计了4对SNP引物。4对SNP引物以2个SNP位点设计,每个SNP位点设计2对SNP标记,并均在引物3'端第二位引入强错配碱基。以2份薄壳种油棕材料和2份厚壳种油棕材料DNA为模板,扩增筛选油棕SHELL基因SNP引物。通过PCR扩增发现,设计的SHELL基因特异SNP标记EgSh(N)-f/EgSh(SNP)-2r能够鉴别油棕厚壳种和薄壳种。再用24株油棕树进行特异性验证,发现该标记能较准确地判断油棕的厚薄壳。该研究结果表明SNP标记EgSh(N)-f/EgSh(SNP)-2r可用来进行油棕种质资源早期分子鉴定,为高产油棕品种选育提供了技术支撑。

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