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基于SRAP分子标记的油梨种质资源遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 甘霖 1 ; 高乐 1 ; 陈丽娜 2 ; 何鹏 1 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院橡胶研究所

2.中国热带农业科学院

关键词: 油梨;SRAP;遗传多样性;群体结构

期刊名称: 南方农业学报

ISSN:

年卷期: 2021 年 007 期

页码: 1798-1805

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】基于SRAP分子标记分析油梨种质资源的遗传多样性,为油梨种质资源新品种选育及创新利用提供理论依据。【方法】以50份油梨种质为材料,从184对SRAP引物组合中筛选出扩增条带清晰且多态性较好的引物组合,利用其对油梨种质材料进行PCR扩增,基于扩增结果,利用PopGene 1.32计算遗传多样性指数;利用NTSYS 2.1的UPGMA(非加权组平均法)计算遗传相似系数,并进行聚类分析。【结果】从184对SRAP引物组合中筛选出17对扩增条带清晰且多态性较好的引物,利用该17对引物对50份供试油梨种质材料进行PCR扩增,共扩增出322条条带,其中多态性条带有206个,平均每条引物扩增出12.12条,多态比率为63.75%。50份油梨种质材料的观测等位基因数(Na)为1.08441.4034,平均为1.2493;有效等位基因数(Ne)为1.00671.6028,平均为1.3390;Nei’s遗传多样性指数(H)为0.06420.1466,平均为0.1439;Shannon’s信息指数(I)为0.06340.1759,平均为0.1308。大岭2号与油梨种质4号的遗传一致度最高(0.9237),遗传相似系数最大(0.92),同时二者之间的遗传距离最小(0.1365),表明大岭2号与油梨种质4号种质间的亲缘关系最近。油梨种质5号与Fuerte间的遗传一致度相对最小(0.3765),且二者间的遗传距离最大(0.8253),说明油梨种质5号和Fuerte的亲缘关系相对最远。在遗传相似系数0.48处,50份油梨种质被分为四大类群,海南白沙油梨种质集中在第Ⅲ类群,海南儋州、广东湛江及广西南宁油梨种质在第Ⅰ、Ⅱ和Ⅳ类群中均有分布,表明海南儋州、广东湛江及广西南宁油梨种质的遗传多样性均较丰富。【结论】海南儋州、广东湛江及广西南宁油梨种质的遗传多样性相对较丰富,可为油梨亲本选配和育种等方面的创新利用提供材料基础。

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