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基于重测序的印度南瓜种质资源遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘静 1 ; 徐玉婷 2 ; 黄钰 1 ; 曾庆国 2 ; 丁兰 1 ; 黄伟忠 1 ; 王尖 3 ; 许小江 1 ;

作者机构: 1.绍兴市农业科学研究院

2.华中农业大学园艺林学学院

3.浙江省农业科学院

关键词: 印度南瓜;基因组重测序;变异位点;系统发育树

期刊名称: 中国蔬菜

ISSN: 1000-6346

年卷期: 2025 年 010 期

页码: 88-94

收录情况: 北大核心

摘要: 南瓜是重要的蔬菜作物之一,具有较高的营养价值与经济价值。为研究印度南瓜商品种的遗传多样性,以52份印度南瓜材料为研究对象,采用二代测序的方法进行基因组重测序,对测序数据过滤后鉴定变异位点,并进行系统发育分析。结果表明:52份印度南瓜材料具有丰富的遗传多样性,单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)和插入缺失标记(insertion-deletion,InDel)位点具有区域集中性,并且两种变异位点在染色体上的分布具有差异性。系统发育分析将52份印度南瓜材料分为7大类,分别包括2、10、1、5、11、7、16份种质,其中第1类群仅有品种锦栗2号和霍比特,第3类群仅有品种俊荣,与其他商品种有较大的遗传差异。研究结果为印度南瓜品种保护和遗传改良提供了丰富的信息。

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