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建鲤MHC classⅠ基因全长cDNA的克隆与序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 周凯 1 ; 张成锋 2 ; 王建新 2 ; 李冰 1 ; 朱健 1 ;

作者机构: 1.南京农业大学无锡渔业学院

2.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心

关键词: 建鲤(Cyprinus carpio var.jian);MHC classⅠ;克隆;序列分析

期刊名称: 淡水渔业

ISSN: 1000-6907

年卷期: 2011 年 41 卷 01 期

页码: 31-37

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用同源克隆和末端快速扩增(RACE)方法克隆了建鲤(Cyprinus carpio var.jian)MHC classⅠ基因全长cD-NA并进行了序列分析。结果显示:实验得到了1914 bp的建鲤的MHC classⅠ全长cDNA序列;建鲤MHC classⅠ基因包括1044 bp的开放阅读框(ORF),118 bp的5'非编码区(UTR)以及752 bp的3'非编码区(UTR),含有保守的半胱氨酸残基,N-糖基化位点。氨基酸序列比对结果显示,建鲤MHC classⅠ与日本鲤的MHC classⅠ相似性最高,为66.0%;与虹鳟、大西洋鲑、青鳉、红鳍东方鲀的相似性分别为54.5%、57.9%、44.3%、42.0%,与小鼠、大鼠、人的相似性分别为29.1%、28.7%、29.7%。

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