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合浦珠母贝基因组微卫星富集文库的构建与分析

文献类型: 中文期刊

作者: 油九菊 1 ; 范嗣刚 1 ; 黄桂菊 1 ; 郝博飞 1 ; 陈飞飞 1 ; 喻达辉 1 ;

作者机构: 1.农业部南海渔业资源开发与利用重点实验室

关键词: 合浦珠母贝(Pinctada fucata);微卫星;磁珠富集

期刊名称: 海洋科学

ISSN: 1000-3096

年卷期: 2015 年 10 期

页码: 8-14

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用生物素标记的(AC)_(15)探针和磁珠富集法构建合浦珠母贝(Pinctada fucata)基因组DNA微卫星富集文库。随机挑选2097个克隆进行筛选,得到483个候选克隆(23.03%),对其中135个阳性克隆测序分析发现122个克隆含有微卫星重复单元(90.37%)。进一步通过序列比对,最终得到65个具有特异微卫星序列的阳性克隆(53.28%),其中包含85个微卫星DNA结构域,其中完美型(perfect)70个,占82.36%;非完美型(imperfect)7个,占8.24%;混合型(compound)8个,占9.41%,重复次数主要分布在5~20(95.74%),平均重复次数为7.83,(AC/GT)n重复所占比例最高(75.53%)。基于微卫星两端的侧翼序列,利用Primer Premier 5.0设计引物,获得11对具有多态性的微卫星引物。本研究为开展合浦珠母贝分子育种及资源评价分析提供了基础资料。

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