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大豆胞囊线虫侵染下野生大豆根组织实时定量PCR分析中内参基因的筛选

文献类型: 中文期刊

作者: 袁翠平 1 ; 齐广勋 2 ; 王玉民 2 ; 赵洪锟 2 ; 刘晓冬 2 ; 王英男 2 ; 李玉秋 2 ; 董英山 3 ;

作者机构: 1.吉林省农业科学院大豆研究所/大豆国家工程研究中心;吉林省农业科学院作物资源研究所

2.;吉林省农业科学院大豆研究所/大豆国家工程研究中心;吉林省农业科学院作物资源研究所

3.;吉林省农业科学院大豆研究所/大豆国家工程研究中心;吉林省农业科学院作物资源研究所;

关键词: 野生大豆;内参基因;实时定量PCR;大豆胞囊线虫

期刊名称: 大豆科学

ISSN: 1000-9841

年卷期: 2018 年 01 期

页码: 22-31

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以高抗和高感HG 0大豆胞囊线虫的野生大豆种质为试验材料,采用q RT-PCR技术检测了ACT11(Glyma.18G290800)、Tubulin-motif(Glyma.19G194800)等24个候选持家基因在不同大豆胞囊线虫侵染时期(接种后9,15和20 d)野生大豆根系中的基因表达情况,除Actin(Glyma.08G182200)出现了非特异扩增外,其它23个持家基因的q RT-PCR扩增效果均理想,扩增特异性高。分析上述23个持家基因的表达丰度,并利用Best Keeper、ge Norm和Normfinder对其表达稳定性进行评价。结果表明:持家基因间的表达丰度不尽相同,而且有些持家基因在不同品种间或不同处理间(接种虫卵和接种水)也存在表达丰度的差异。23个持家基因的表达稳定性也不相同,综合来看,表达最不稳定的基因为Cons9(Glyma.10G152200)、Cons2(Glyma.17G138500)、Cons1(Glyma.15G270900)和Tubulin-motif(Glyma.20G136000),本试验条件下它们不适宜作内参基因;其余持家基因相对稳定,本试验条件下可选择Tubulinmotif(Glyma.15G132200),Cons6/SKIP16(Glyma.12G051100)或Tubulin-motif(Glyma.05G110200)作为内参基因,它们表达量较高,表达最为稳定,其Ct平均值分别为25.7、26.5和25.0,标准偏差分别为0.540、0.575和0.490,ge Norm软件评价其稳定性的M值分别为0.698、0.715和0.727。该研究为野生大豆抗胞囊线虫相关基因的表达分析提供了参考。

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