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胡萝卜DcSE基因的克隆、进化及根发育过程表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王堃 1 ; 谭国飞 1 ; 孟平红 1 ; 罗庆 1 ; 钟秀来 1 ; 王天文 1 ;

作者机构： 1.贵州省园艺研究所

关键词： 胡萝卜;DcSE;根发育;进化分析;表达分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2021 年 020 期

页码： 6641-6652

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 皂苷物质是"参"中重要的营养物质之一,鲨烯环氧酶（squalene epoxidase, SE）在催化皂苷物质合成中有着重要作用。本研究以‘黑田五寸’胡萝卜为材料,克隆出DcSE基因。结果表明,DcSE的基因片段长度为1 896 bp,可编码氨基酸长度为631 aa;其核苷酸序列与公布的胡萝卜基因序列同源性为99.58%,存在8个位点差异;推导的氨基酸序列与公布的胡萝卜该氨基酸序列同源性达99.21%,存在5个位点差异,预测为亲水性蛋白。分子进化树分析表明,DcSE与伞形科的芹菜、欧芹进化距离较近,不同科植物能够很好地聚在各自分枝中;微生物、动物和植物之间的SE进化较远,处在不同分枝中。实时定量PCR表达分析显示,DcSE在胡萝卜肉质根发育过程中均有表达,表达量呈逐渐上升趋势,在60～100 d时稳定表达,且表达量最高。本研究克隆得到的胡萝卜DcSE基因或与人参等物种中SE具有相同或类似功能,这为进一步探究胡萝卜肉质根中皂苷物质的合成途径提供了参考。

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