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利用SSR、EST-SSR、SNP标记对鲤食物转化率、体厚、体质量3种性状的分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王宣朋 1 ; 张晓峰 1 ; 李文升 1 ; 张天奇 1 ; 孙效文 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

关键词： 鲤;EST-SSR;SNP;食物转化率;体厚;体质量

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2011 年 18 卷 03 期

页码： 565-573

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用Windows Map Manager2.0的标记回归法对鲤(Cyprinus carpio L.)F2群体进行单标记定位分析。用91个SSR标记、33个EST标记、364个SNP标记对鲤进行全基因组扫描,结果得到与食物转化率、体厚、体质量3个性状显著相关(P<0.05)的标记,分别为27、35、27个,其中与食物转化率相关的标记SNP0041、SNP0044,其相关性达到极显著水平(P<0.001),贡献率分别达到15%、16%。这些标记可作为分子标记辅助育种的参考标记。将得到的与食物转化率显著相关的EST座位HLJE14、HLJE253和与体质量显著相关的HLJE253座位在NCBI上进行BLAST比对,结果显示HLJE253与斑马鱼上编码ORF2结构蛋白的基因相关,相关程度达61%。将得到的与3种性状相关的SNP标记在NCBI上进行序列查找,通过Blast比对找到相关的基因,并对可能的功能作了注释。

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