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贵州省猪戊型肝炎的分子流行病学调查

文献类型: 中文期刊

作者: 任荣清 1 ; 张登祥 2 ; 徐景峨 1 ; 杨茂生 3 ; 王祥兴 4 ;

作者机构: 1.贵州省畜牧兽医研究所

2.贵州大学动物科学学院

3.贵州省畜牧兽医科学研究所

4.贵州省畜牧兽医研究所贵州省动物疫病预防控制中心安龙县畜牧兽医局

关键词: 猪;戊型肝炎病毒;基因型;反转录巢式聚合酶链反应;流行病学调查

期刊名称: 中国兽医科学

ISSN: 1673-4696

年卷期: 2011 年 09 期

页码: 960-967

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采集贵州省戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)抗体阳性的6个猪场新鲜猪粪便样品216份,提取RNA,通过RT-nPCR扩增HEV ORF2基因,对阳性PCR产物进行克隆和测序,采用MEGA5.05软件进行序列比对,构建系统发生树,并经流行病学分析,调查了贵州省猪群的HEV感染情况及基因型。结果显示,HEV主要感染1月龄以上的未成年猪群;粪样采集的6个猪场均不同程度(5.88%~56.52%)地检出HEV RNA阳性,总体阳性率为22.69%(49/216),场群阳性率为100%(6/6);不同类型猪场(养殖户型和养殖场型)HEV RNA阳性率(分别为41.10%和13.29%)差异具有统计学意义(P<0.01),养殖户之间及养殖场之间的阳性率差异无统计学意义(P>0.05),但随着饲养时间的延长,这2种类型猪场的粪便HEV RNA检出率呈上升趋势;测序36个PCR阳性分离株(占73.5%),序列一致性为91.1%~100%,与HEV禽型及Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ型的一致性分别为52.4%~55.4%、75.2%~77.9%、73.6%~75.9%、72.7%~79.1%、83.2%~95.6%,系统发生分析显示与Ⅳ型在同一分支上,属于基因Ⅳ型。结果表明,贵州省猪群普遍存在HEVⅣ型感染。

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