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枣树水通道蛋白基因生物信息学分析及原核表达载体的构建

文献类型： 中文期刊

作者： 张洁 1 ; 杨大威 2 ; 孟玉平 3 ; 赵玉云 3 ; 曹秋芬 1 ;

作者机构： 1.山西大学生物工程学院

2.山西农业大学研究生院

3.山西省农业科学院农业生物技术研究中心

关键词： 枣树;水通道蛋白;生物信息学分析;原核表达

期刊名称： 山西农业科学

ISSN： 1002-2481

年卷期： 2010 年 38 卷 01 期

页码： 6-10

收录情况： CSCD

摘要： 利用生物信息学软件对已获得的枣树水通道蛋白基因cDNA序列ZjPIP2(DDBJ/EMBL/GenBank的注册号为:AB530493)进行了同源性及功能位点等多项参数分析,结果表明,此序列为全长846 bp的开放读码框(ORF),编码281氨基酸,分子量为29.87 kD,理论等电点为8.77;具有膜蛋白(MIP)家族典型的保守氨基酸序列HINPAVTFG和2个NPA保守肽段。序列相似性分析表明,该蛋白与已知的其他12种植物膜蛋白中的水通道蛋白具有极高的同源性,属于水通道蛋白的质膜膜内蛋白PIP2类。三级结构预测表明,其与菠菜(Spinacia oleracea)水通道蛋白(1z98A)有相似的三维结构。以克隆载体pSPORT1携带的枣树水通道蛋白基因cDNA序列为模板,PCR扩增后,经BamHⅠ和SalⅠ消化,与pET28a载体进行重组连接,测序结果显示,其原核表达载体构建成功。此结果为研究枣水通道蛋白基因在植物组织的分布、生物学功能以及可能的活性调节方式奠定了基础。

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