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海南黑山羊鞭虫rDNA-ITS片段的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 荣光 1 ; 周汉林 1 ; 侯冠彧 1 ; 王东劲 1 ; 赵军明 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院

关键词： 鞭虫;ITS;PCR;克隆;序列分析

期刊名称： 西北农业学报

ISSN： 1004-1389

年卷期： 2010 年 19 卷 12 期

页码： 27-30+62

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用寄生线虫通用引物NC5和NC2,对海南黑山羊鞭虫rDNA的ITS序列进行PCR扩增,将扩增片段纯化后克隆至pEASY-T1载体。用PCR及酶切进行鉴定,对阳性菌落质粒DNA进行测序分析。结果表明,扩增的黑山羊鞭虫ITS片段大小为1 113 bp,包含部分的18S、28S及全部的ITS1(470 bp)、5.8S(158bp)和ITS2(392 bp)序列,ITS1和ITS2与GenBank已登录的Trichuris skrjabini(Baskakov)同源性分别达到90%和99%,与T.leporis(Froelich)同源性均为84%,而与其他科线虫同源性均较低。由ITS1和ITS2序列构建的系统进化树可知,从海南黑山羊盲肠中分离到的鞭虫ITS1和ITS2均与T.skrjabini处于同一分支。研究结果为海南黑山羊盲肠鞭虫种属的确定及进一步分子生物学研究奠定基础。

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