文献类型： 中文期刊

作者： 王文文 ¹ ; 朱颖 ¹ ; 位战飞 ² ; 郑卫卫 ² ; 董忠典 ¹ ; 高峰涛 ¹ ; 邵长伟 ² ; 温海深 ¹ ; 陈松林 ² ;

作者机构： 1.中国海洋大学水产学院

2.中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词： 半滑舌鳎;三重基序蛋白基因(trim36);克隆;qRT-PCR;原位杂交

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2016 年 24 卷 07 期

页码： 968-979

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 三重基序蛋白(the tripartite motif-containing protein,TRIM)家族是一类结构保守、进化快速的E3泛素蛋白连接酶,参与诸多重要的生命过程。TRIM36是TRIM家族的一员,trim36编码E3泛素蛋白连接酶。本研究在已完成的半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)全基因组测序及转录组测序的基础上,利用RACE技术克隆得到半滑舌鳎trim36基因(Gen Bank登录号:KU244470),序列全长为2 899 bp,其中ORF为2 214 bp,编码737个氨基酸,5'非翻译区(untranslated regions,UTR)为289 bp,3'UTR为396 bp。生物信息学分析显示,半滑舌鳎TRIM36蛋白包含1个锌指结构,2个B-BOX类型锌指蛋白结构域(B-Box-type zinc finger,BBOX),1个卷曲螺旋结构,1个羧基末端的纤连蛋白Ⅲ(fibronectin typeⅢ,FN3)结构域和1个双特异性蛋白激酶spla和兰尼碱受体(spla kinase and ryanodine receptor,SPRY)结构域。此外,在不同脊椎动物中,trim36基因与其邻近的基因具有保守的共线性关系。半定量RT-PCR及q RT-PCR结果显示,在半滑舌鳎不同组织中,trim36基因表达存在差异。trim36在卵巢中表达量最高,其次为雌、雄鱼的脑中;不同发育时期中,trim36基因在120日龄半滑舌鳎性腺中开始表达,且卵巢表达量显著高于精巢(P<0.05)。原位杂交结果显示,trim36基因杂交信号主要出现在Ⅰ期和Ⅱ期卵母细胞。trim36时空表达特征表明,其在卵巢腔的形成及Ⅰ期、Ⅱ期卵母细胞的形成中起重要作用。结果表明,trim36在性别发生方面有一定的作用,这为进一步研究鱼类trim36基因功能及TRIM家族基因功能提供线索和参考。