文献类型： 中文期刊

作者： 金勇丰 ¹ ; 边腾飞 ¹ ; 周萍 ² ;

作者机构： 1.浙江大学生物化学研究所

2.浙江省农业科学院蔬菜研究所

关键词： uORF;uATG;植物;统计分析

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1006-1304

年卷期： 2004 年 12 卷 05 期

页码： 11-17

收录情况： CSCD

摘要： 真核生物 mRNA 5′非编码区上游可译框(uORF)在基因翻译水平上的调控具有重要作用。对植物2200多个 cD-NA 序列5′非编码区的 uATG 和 uORF 进行统计分析,结果表明,含 uATG 的基因高达18%,这一比例比估计的10%要高得多,其中含单个 uATG 的基因约占50%,含2个 uATG 的基因占20%左右;大部分 uORF 属于非交叉 uORF,约占85%;编码1～5氨基酸的 uORF 占30%以上,大部分 uORF 编码多肽小于20个氨基酸,占77.6%;mRNA ORF 起始密码子 ATG 的两边序列有显著的偏爱性,与植物共有序列 UAAACAAUGGCU 或 AACAAUGGC 基本一致,但有 uATG 的 mRNA ORF 起始密码子 ATG的两边序列比不含 uATG 的 mRNA ORF 起始密码子 ATG 的两边序列偏爱性要差。大多数 uATG 两边序列缺乏植物 ORF 起始密码子 ATG 的两边序列的偏爱性。不同种属 mRNA5′非编码区 uORF 氨基酸并不具有显著的同源性.如果植物 S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶等少数基因具有非常保守的 uORF,氨基酸序列同源性高达75%～100%,显著高于植物 S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶之间的同源性。