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10个半滑舌鳎家系MHC ⅡB基因多态性初步研究

文献类型： 中文期刊

作者： 牛宝珍 1 ; 杜民 2 ; 陈松林 3 ;

作者机构： 1.红河学院云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室

2.云南省红河学院生命科学与技术学院

3.中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词： 半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis);多态性;MHCⅡB;平衡选择

期刊名称： 海洋科学

ISSN： 1000-3096

年卷期： 2015 年 39 卷 12 期

页码： 70-76

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为检测10个半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)家系MHCⅡB(Cyse-DAB)基因的多态性水平、MHCⅡ类B位点数目以及平衡选择的作用,作者利用多聚酶链式反应(PCR)和直接测序的方法对10个半滑舌鳎家系MHCⅡB基因位点遗传变异和平衡选择进行了研究。用特异性引物和PCR扩增的半滑舌鳎MHCⅡB基因片段大约397 bp,包含一部分第一外显子,全部第一内含子和全部第二外显子。10个半滑舌鳎家系中,每家系选取5个体,每个体5个克隆序列分析发现60个不同序列,代表60个等位基因,其中有28个是新发现的,已提交到Gen Bank。同源分析表明60个等位基因相似性为89.36%。共50个个体中,有6个存在5个不同等位基因,表明在半滑舌鳎至少存在3个座位。有9个家系的MHCⅡB序列多肽结合区(PBR)的非同义替换(dN)显著高于同义替换(dS)。

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