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玉米HKT基因家族全基因组鉴定及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 孙博 1 ; 张春宵 2 ; 刘俊宇 1 ; 焦仁海 2 ; 董菁 2 ; 吴松权 1 ; 李晓辉 2 ;

作者机构: 1.延边大学农学院

2.吉林省农业科学院玉米研究所

关键词: 玉米;HKT基因家族;生物信息学;盐碱胁迫;基因表达

期刊名称: 玉米科学

ISSN: 1005-0906

年卷期: 2024 年 32 卷 009 期

页码: 20-31

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 基于14个物种的HKT基因家族构建系统进化树,深入分析模式作物拟南芥及玉米、高粱、水稻3个亲缘关系较近的禾本科物种HKT家族成员的基因结构、保守基序及其蛋白质理化性质等,对玉米HKT基因家族进行全基因组鉴定和系统的生物信息学分析。分别用200 mmol/L NaCl和100 mmol/L Na2CO3对郑58(抗)和昌7-2(感)的玉米幼苗进行盐、碱胁迫处理,在胁迫0、1和3 d时取叶部及根部样品进行转录水平分析。结果表明,14个物种的HKT家族成员在系统进化树划分为两个支系,推测可能至少来自两个共同的祖先基因。HKT家族具有相似的基因结构和特殊的基因特征,玉米HKT基因家族中共有包括1个I型和两个II型在内的3个成员,推测拥有更多的HKT基因家族成员有助于植物在盐碱环境下获得更广泛的适应性。此外,盐碱处理下基因表达分析显示,郑58和昌7-2的耐盐碱性差异与ZmHKT1;1直接相关,与ZmHKT2;1间接相关,与ZmHKT1;2无关。

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