文献类型： 中文期刊

作者： 邵欣欣 ¹ ; 李涛 ² ; 李植良 ² ; 宇丽 ³ ; 黎振兴 ² ;

作者机构： 1.暨南大学

2.广东省农业科学院蔬菜研究所

3.暨南大学生命科学技术学院广东省农业科学院蔬菜研究所广东省蔬菜新技术研究重点实验室暨南大学医学院

关键词： 茄子;AP2/ERF转录因子;生物信息学分析;表达分析;逆境胁迫

期刊名称： 植物生理学报

ISSN： 2095-1108

年卷期： 2015 年 11 期

页码： 1901-1918

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 植物AP2/ERF是一个庞大的转录因子家族,在植物的生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中发挥重要作用。本研究在茄子基因组范围内,利用生物信息学方法对茄子AP2/ERF转录因子家族的成员、分布及结构和功能等进行分析。结果表明,茄子AP2/ERF家族包含130个蛋白质,其中AP2、RAV、ERF亚家族分别含有20、2和108个,ERF分为DREB/CBF(41个成员)和ERF(67个成员)两大亚族,进化分析将二者分为11个小亚族。MEME分析表明其含有20个重要基序,相同亚族中的ERF成员蛋白序列的氨基酸保守域构成相似,且各亚族成员的氨基酸保守域组成类似,表明这些基序的存在对ERF蛋白功能的执行是必需的。利用实时荧光定量PCR对茄子38个ERF基因进行组织表达分析,结果表明其存在组织表达差异;胁迫响应分析结果表明,33个基因受ABA、SA、盐、重金属镉、高温和低温诱导表达,其中部分基因显著上调或下调表达,可能参与茄子逆境胁迫条件下的防御应答反应。本研究结果将为茄子AP2/ERF家族基因的深入研究提供依据,为进一步解析AP2/ERF基因功能奠定基础。