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蒙古冰草XTH基因生物信息学及干旱胁迫下表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 陈艺豪 1 ; 房永雨 2 ; 范菠菠 1 ; 张学峰 1 ; 赵彦 3 ; 闫秀秀 1 ; 吴婧 1 ; 翟永青 1 ; 于卓 1 ; 马艳红 1 ;

作者机构: 1.内蒙古农业大学农学院

2.内蒙古自治区农牧业科学院草原研究所

3.内蒙古农业大学草原与资源环境学院

关键词: 蒙古冰草;XTH;生物信息学分析;基因表达

期刊名称: 中国农业大学学报

ISSN: 1007-4333

年卷期: 2025 年 30 卷 001 期

页码: 55-64

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为筛选出蒙古冰草(Agropyron mongolicum Keng)抗旱相关的XTH基因,利用生物信息学方法对其理化性质、亚细胞定位、保守基序、进化关系及二、三级结构进行分析,并对4个抗旱相关的XTH基因进行表达分析。结果表明:筛选得到的7个蒙古冰草XTH基因,蛋白大小位于70~357 aa,分子质量为7.67~39.46 ku,理论等电点(PI)在4.67~9.81,均为亲水性蛋白;亚细胞定位表明AmXTH-1定位在细胞壁和细胞质,其余6个定位于细胞壁。XTH基因的二、三级结构以无规则卷曲为主,推测motif1、motif2和motif3为保守基序。进化关系比对发现AmXTH30、AmXTH28-1、AmXTH-1和AmXTH8-1与已知具有抗旱功能的基因具有较高相似性。qRT-PCR分析表明,4个与蒙古冰草抗旱相关的XTH基因均呈下调表达。推测蒙古冰草中差异表达的4个XTH基因在响应干旱胁迫中起负调控作用。

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