文献类型： 中文期刊
作者： 金龙飞 1 ; 尹欣幸 1 ; 曹红星 1 ;
作者机构： 1.中国热带农业科学院椰子研究所/海南省热带油料作物生物学重点实验室
关键词： EgGRF;油棕;生物信息学;基因表达
期刊名称： 热带作物学报
ISSN：
年卷期： 2021 年 007 期
页码： 1817-1823
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 生长调控因子（Growthregulatingfactor,GRF）是植物中重要的转录因子,参与植物生长、发育和逆境胁迫响应等多种生物学过程。本研究从油棕（Elaeisguineensis）基因组中鉴定出15个EgGRF基因家族成员,并对其理化性质、染色体定位、基因结构、保守功能域、进化关系、启动子顺式作用元件、组织表达模式和果肉不同时期表达模式进行分析。结果表明:EgGRF基因家族成员编码的肽链平均为409个氨基酸,分子量为27.62～65.51 kDa,等电点为6.24～9.38,蛋白不稳定指数为47.24～68.37,脂溶指数为47.52～67.69,总平均亲水性为–0.945～–0.400。EgGRF基因家族成员含有3～5个外显子,均含有特征结构域QLQ（Gln、Leu、Gln）和WRC（Trp、Arg、Cys）,基于系统进化关系将EgGRF家族分为5个亚族,油棕EgGRF的亲缘性与拟南芥较近。启动子上鉴定出大量植物激素响应、逆境胁迫响应、光响应和分生组织特异表达顺式作用元件。不同组织的转录组数据分析结果表明,EgGRF基因家族在茎尖和花中表达量较高,8个EgGRF在果肉的不同时期特异表达。本研究为进一步探索EgGRF调控油棕生长发育过程的机制奠定基础。
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