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基于GBS技术的铁皮石斛种质群体遗传结构分析

文献类型: 中文期刊

作者: 付曼曼 1 ; 吴超 1 ; 丁晓瑜 1 ; 林森洪 1 ; 黎侠 1 ; 郭方其 1 ;

作者机构: 1.浙江省农业科学院园艺研究所

关键词: 铁皮石斛;GBS;SNP;系统进化树;群体遗传结构

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2022 年 023 期

页码: 7950-7959

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 铁皮石斛是中国传统的名贵中药材,具有抗氧化、抗衰老、增强免疫力等功效。本研究旨在通过GBS技术探讨不同省份来源的铁皮石斛的群体遗传结构。以59份来自不同省份的铁皮石斛为材料提取DNA,构建文库,库检合格后上机测序,测序数据质量合格后进行酶切,然后基于石斛参考基因组进行单核苷酸多态性检测,分析其进化树、主成分及遗传结构。从59份铁皮石斛样本中获得有效数据51.442 G,高质量SNP位点为69 943个,进化树分析结果显示59份不同省份来源的铁皮石斛可被分为3组,来自云南的品种与浙江的品种亲缘关系较近,主成分分析和群体遗传结构分析结果与进化树结果相一致。本研究结果可为铁皮石斛种质资源的收集和保护提供依据,为挖掘优良种质及培育优良品种提供资源。

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