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江苏葫芦科作物上瓜类褪绿黄化病毒的发生及其分离物全基因组序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 杨柳 1 ; 任春梅 1 ; 陆芳 1 ; 缪倩 1 ; 程兆榜 1 ; 季英华 1 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院植物保护研究所

关键词： 瓜类褪绿黄化病毒;分布;分子鉴定;基因组;系统进化分析

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2024 年 006 期

页码： 36-42

收录情况： 北大核心

摘要： 为了分析瓜类褪绿黄化病毒（cucurbit chlorotic yellow virus, CCYV）在江苏省葫芦科作物上的分布情况、发生趋势以及变异情况，本研究对疑似感染CCYV的葫芦科样本进行采集，覆盖了江苏省8个地区的7种常见葫芦科作物，通过RT-PCR方法对病样进行了分子鉴定，并对在泰州采集的黄瓜分离物CCYV-JSXH进行分段克隆与测序，拼接获得CCYV的全基因组序列后对其进行了序列比对和进化分析。检测结果显示，在建湖采集的西葫芦样本、泰州兴化和南京江宁地区采集的黄瓜样本均有CCYV感染。序列拼接与比对结果显示，分离物CCYV-JSXH的RNA1序列与目前已经公布的各个分离物基因组序列相似度在99.58%以上，在进化树上与山东西葫芦分离物聚为一支；其RNA2序列与各分离株的相似性为99.47%以上，在进化上与广东分离物聚为一支。本研究结果表明，CCYV可能由多个途径传入江苏，并已经扩大蔓延到江苏省多个地区和多种寄主上，对该病毒的监测防控已逐渐扩大为葫芦科作物生产中亟待解决的突出问题之一。

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