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香蕉幼果SSH文库构建及初步分析

文献类型： 中文期刊

作者： 颜园园 1 ; 王静毅 2 ; 冯素萍 2 ; 陈友 2 ; 武耀廷 3 ;

作者机构： 1.海南大学农学院

2.中国热带农业科学院热带作物生物技术研究所

3.琼州学院

关键词： 皇帝蕉;果实发育;抑制差减杂交;cDNA文库

期刊名称： 果树学报

ISSN： 1009-9980

年卷期： 2013 年 30 卷 03 期

页码： 373-380

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】构建香蕉果实发育抑制差减文库,筛选果实发育相关基因。【方法】以皇帝蕉幼果为实验组,幼叶为对照组,构建差减文库,并用Blast2GO软件进行生物信息学分析。【结果】挑选982个重组子菌液PCR筛选cDNA文库,得到750个候选克隆。对其中200个克隆进行测序、去载体序列、拼接后,获得92个unigenes。在GenBank中进行同源性比较,共有81个找到同源序列,11个cDNA未找到同源序列。75个unigenes在GO数据库中有功能注释,涉及到的细胞组分、分子功能和生物过程分别为53个、72个和60个,显示果实发育差异主要与在细胞内部组分进行的代谢过程的强度,以及其他一些因子和激酶的影响有关。【结论】成功构建皇帝蕉果实的差减cDNA文库,为进一步开展香蕉果实发育相关基因如tubulin、P450等基因的克隆及功能鉴定奠定了重要基础。

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