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稻曲病菌的SCAR标记及其PCR检测

文献类型: 中文期刊

作者: 陈福如 1 ; 林廷邦 2 ; 甘林 1 ; 杜宜新 1 ; 阮宏椿 1 ; 杨秀娟 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院植物保护研究所

2.福建农林大学植物保护学院

关键词: 水稻;稻曲病菌;RAPD特异片段;SCAR标记;PCR检测

期刊名称: 植物保护学报

ISSN: 0577-7518

年卷期: 2013 年 40 卷 06 期

页码: 481-487

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为建立稻曲病菌Ustilaginoidea virens快速、灵敏的PCR早期检测技术,以S380为引物,对稻曲病菌和其它参试病原菌的DNA进行RAPD-PCR扩增。稻曲病菌RAPD特异片段经回收、克隆和测序后,根据序列用Primer 5.0软件设计了特异性SCAR引物US-SF(5'-TCGCCTCAGACCTCAATC-3')/US-SR(5'-GAGCCTCAAATGCCTTCC-3')和巢式PCR引物US-NF(5'-AGCGTCTCCTGCAACCAC-3')/US-NR(5'-GAGCCTCAAATGCCTTCC-3')。利用引物US-SF/US-SR通过常规PCR对供试稻曲病菌均可扩增出1条大小约257 bp的清晰条带,对其它植物病原菌DNA的PCR产物均无扩增条带,最低可检测到1 pg/μL的病菌基因组DNA;而利用引物US-SF/US-SR和US-NF/US-NR通过巢式PCR可从10 fg/μL的病菌基因组DNA中扩增出1条大小约210 bp的特异性条带。试验表明,巢式PCR检测灵敏度比常规PCR提高了100倍,且巢式PCR可从接菌的水稻幼颖和自然感染的谷粒中检测出稻曲病菌。

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