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海绵Pachychalina sp.体内古菌多样性非培养技术分析

文献类型： 中文期刊

作者： 方再光 1 ; 黄惠琴 1 ; 张开山 1 ; 潘志强 1 ; 鲍时翔 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室

关键词： 海绵Pachychalina sp.;16SrDNA;ARDRA;古菌多样性

期刊名称： 微生物学报

ISSN： 1005-7021

年卷期： 2005 年 45 卷 01 期

页码： 121-124

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用非分离培养分析方法 ,即 16SrDNA限制性酶切片段长度多态性 (ARDRA)和测序方法对南海湛江海域海绵Pachychalinasp .体内的古菌多样性进行了研究。从海绵体内直接提取古菌总DNA。以样品总DNA为模板 ,用古菌 16SrDNA通用引物进行PCR扩增获得 16SrDNA ,回收、纯化 16SrDNA产物并克隆到T Vector。进行第二次PCR扩增反应 ,且对扩增产物进行ARDRA。在古菌 16SrDNA的ARDRA图谱中 ,大多数克隆的酶切带谱上存在差异 ;随机挑选 8个克隆子进行测序 ,获得古菌 16SrDNA的部分序列 ,并对 16SrDNA序列进行聚类分析构建了系统进化树 ,结果发现海绵体内的古菌主要属于Methanogeniumorganophilum、Methanoplanuspetrolearius等古菌类。但它们与目前数据库中收录的古细菌间的相似性均不超过 90 % ,它们极有可能是一些新的古菌

  • 相关文献

[1]海绵Pachychalina sp.体内细菌多样性的研究. 方再光,黄惠琴,蔡海宝,吕家森,鲍时翔. 2004

[2]Phylogenetic diversity of bacteria and Archaea associated with the marine sponge Pachychalina sp.. Cheng, Na,Fang, Zaiguang,Huang, Huiqin,Fang, Zhe,Wu, Xiaopeng,Bao, Shixiang. 2008

[3]假臭草丛枝病植原体16SrDNA检测与PCR-RFLP分析. 王真辉,陈秋波,郭志立,叶岸青,张浩. 2007

[4]海南槟榔黄化病病原物的分子鉴定. 车海彦,吴翠婷,符瑞益,温衍生,叶莎冰,罗大全. 2010

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[10]热带土壤解磷细菌PSB26的筛选鉴定及拮抗初探. 王义,余贤美,郑服丛. 2009

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