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淮猪与苏山猪骨骼肌转录组差异基因筛选

文献类型: 中文期刊

作者: 田紫金 1 ; 李碧侠 2 ; 吴萍 1 ; 赵为民 2 ; 任同苏 3 ; 季香 3 ; 王韶山 3 ;

作者机构: 1.江苏科技大学蚕业研究所

2.江苏省农业科学院畜牧研究所

3.江苏东海老淮猪产业发展有限公司

关键词: 淮猪;苏山猪;猪肉品质;转录组测序

期刊名称: 中国畜牧杂志

ISSN: 0258-7033

年卷期: 2025 年 61 卷 011 期

页码: 150-158

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为探索猪肉品质形成的分子机制,本研究以我国著名的华北型地方猪种淮猪和地方猪种与外来猪种杂交形成的培育品种苏山猪为试验材料,通过胴体品质测定和转录组测序分析,挖掘影响猪肉品质形成的关键基因.结果表明:淮猪的肉色L*、肌内脂肪含量高于苏山猪(P<0.05),肉色a*、pH24 h高于苏山猪(P<0.01),失水率、粗蛋白含量低于苏山猪(P<0.01);对淮猪和苏山猪背最长肌进行转录组测序分析,共获得 12 961个基因,筛选出 1 195 个差异表达基因(Differentially Expressed Genes,DEGs),其中 472 个DEGs在淮猪中表达上调,723 个DEGs在苏山猪中表达上调;通过富集分析,筛选出与PPAR信号通路等相关的肉质差异候选基因 7 个,包括FABP3、PPARA、LPL、PDK4、NR4A3、PLIN5和ACSL1.通过构建DEGs的PPI网络,得到 80 个核心基因,筛选出与肉质差异相关的候选基因 8 个,包括MYL2、MYL3、TNNC1、TNNI3、PRKAA2、PRKAG3、GPI和PKM.本研究为提升猪肉品质的分子改良提供了重要靶基因.

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