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草菇培养料中微生物总DNA的高效提取

文献类型： 中文期刊

作者： 李玉 1 ; 孟丽 1 ; John A. Buswell 2 ; 陈明杰 2 ; 宋金俤 3 ;

作者机构： 1.吉林农业大学

2.上海市农业科学院食用菌研究所

3.江苏省农业科学院蔬菜研究所

关键词： 草菇培养料;DNA;微生物;PCR扩增

期刊名称： 东北林业大学学报

ISSN： 1000-5382

年卷期： 2011 年 39 卷 11 期

页码： 58-62

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 比较了化学裂解与酶裂解相结合法、氯化苄法、CTAB法、改良CTAB法、MP土壤试剂盒法和植物试剂盒法6种提取草菇培养料总DNA的方法。结果表明:不同方法的A260/A280比值有较大差异,其中化学裂解与酶裂解相结合法提取DNA的产量最高,而新型植物基因组DNA提取试剂盒提取培养料DNA的产量最低,分别为(2 372.72±28.85)μg/g和(87.67±2.04)μg/g。采用真菌、细菌及放线菌特异性引物进行PCR扩增,结果表明,除氯化苄法没有扩增出目的条带外,其余方法均能扩增出目的条带,说明其均能从草菇培养料中同时有效地提取真菌、细菌和放线菌总DNA。综合评价了各方法的DNA产量、纯度、PCR扩增效果、试验时间、费用成本5个指标,其中采用化学裂解与酶裂解相结合法提取出的DNA产量最高,但所用时间较长;MP土壤试剂盒提取的DNA纯度最高、所需时间较短,但成本较高。

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